在合同纠纷中，如果被告与第三人之间有合同，但与原告之间没有直接的合同关系，这通常意味着被告可能不是基于与原告之间的合同关系而被起诉的。针对这种情况，以下是一些建议和分析：

1. 明确法律关系：

   • 首先，被告需要明确自己与原告之间的法律关系。如果双方确实没有合同关系，那么被告应当基于这一点进行抗辩。
   • 被告需要仔细审查原告的诉讼请求和事实理由，确定原告是基于何种法律关系提起诉讼的。

2. 搜集证据：

   • 即便没有直接的合同，被告也应当尽力搜集其他相关证据来证明自己与原告之间的法律关系或反驳原告的诉讼请求。
   • 这些证据可能包括往来邮件、聊天记录、付款凭证、交货凭证等，这些都能间接反映双方之间的交易或沟通情况。

3. 抗辩策略：

   • 如果被告确实与原告没有合同关系，那么可以明确抗辩称双方不存在合同关系，因此不应承担合同责任。
   • 被告还可以从原告提供的证据中寻找漏洞或不一致之处，以质疑原告的主张。

4. 法院调查取证：

   • 如果被告认为有必要，可以向法院提出申请，请求法院进行调查取证，以查明案件事实。
   • 法院会根据案件的具体情况来决定是否准许该申请。

5. 积极应诉：

   • 无论被告与原告之间是否存在合同关系，被告都应当积极应诉，向法院阐述自己的观点和理由。
   • 被告需要全力配合法院的审理工作，包括提交证据、参加庭审等。

6. 考虑其他法律关系：

   • 如果双方虽然没有直接的合同关系，但存在其他法律关系（如侵权、不当得利等），被告也需要根据这些法律关系进行相应的抗辩和举证。

综上所述，被告与第三人之间有合同但与原告没有合同的情况下，被告应当明确自己与原告之间的法律关系，搜集相关证据进行抗辩，并积极应诉配合法院的审理工作。如果有需要，还可以向法院申请调查取证以查明案件事实。