当甲方不是付款主体时，处理这种情况主要依赖于合同的具体条款以及相关法律法规。以下是一些建议来帮助您应对这种情况：
一、明确合同条款
核查合同：
- 首先，仔细审查合同，特别是关于付款条款的部分。确认合同中是否明确规定了付款主体，以及是否有关于代付、委托支付或第三方支付等安排。
识别付款主体：
- 如果合同中明确规定了付款主体不是甲方，而是第三方（如乙方、丙方或其他指定方），那么应确保该第三方具备支付能力，并了解其与甲方之间的关系。
理解“代”支付：
- 如果合同中使用了“代”支付等字眼，应明确这是否意味着甲方仅作为代理或中介来协助完成支付，而实际的付款责任仍由另一方承担。
二、法律与合规性考虑
法律依据：
- 参考相关法律法规，如《中华人民共和国民法典》中关于合同约束力的规定，确保您的权益得到法律保护。
《保障中小企业款项支付条例》：
- 如果您是中小企业，可以关注《保障中小企业款项支付条例》中关于付款期限、非现金支付方式、无争议款项付款义务等规定，以确保您的款项得到及时支付。
三、沟通与协商
与甲方沟通：
- 与甲方进行沟通，了解其不直接作为付款主体的原因，并探讨可能的解决方案。例如，是否可以要求甲方提供付款担保或保证，以确保款项的支付。
与付款主体沟通：
- 直接与合同中规定的付款主体进行沟通，确认其支付意愿和能力，并了解其支付计划和流程。
协商修改合同：
- 如果可能，可以与各方协商修改合同条款，明确付款主体和支付责任，以避免未来的纠纷。
四、采取法律行动
发送催款通知：
- 如果款项未按期支付，可以向付款主体发送正式的催款通知，要求其履行支付义务。
寻求法律援助：
- 如果沟通无果，可以考虑寻求法律援助，如咨询律师或提起诉讼，以维护您的合法权益。
五、总结与建议
- 在签订合同时，应尽可能明确付款主体和支付责任，避免使用模糊或含糊不清的表述。
- 如果遇到甲方不是付款主体的情况，应及时与各方沟通并寻求解决方案。
- 在必要时，可以寻求法律援助来维护自己的权益。
总之，处理甲方不是付款主体的情况需要综合考虑合同条款、法律法规以及实际情况，通过沟通与协商寻求最佳解决方案。