首先，我们需要明确“弃标”和“废标”的含义及其在法律上的后果。

1. 弃标：是在中标通知书发出后，中标人自动放弃中标的行为。根据《中华人民共和国招标投标法》第四十五条及相关规定，中标人放弃中标项目的，应当依法承担法律责任，包括赔偿招标人的损失，且投标保证金不予退还。

2. 废标：则是指因特定原因（如报名参加的供应商不足三家、存在违法违规行为等）导致招标采购单位作出的全部投标无效的处理。

针对用户的问题“施工单位在中标后发弃标函，代理公司是发废标公告吗？”我们可以从以下几个方面进行回答：

1. 中标后弃标的法律后果：

   • 中标人发出弃标函后，其中标资格将被取消，且需要承担法律责任，包括赔偿招标人的损失和投标保证金不予退还。

2. 代理公司的行为：

   • 当中标人弃标后，代理公司（通常指招标代理机构）并不直接发出“废标公告”。废标通常是在招标过程中因特定原因导致的全部投标无效，而中标后的弃标是中标人单方面的行为。
   • 代理公司可能会根据招标文件的约定和法律法规的要求，对中标人的弃标行为进行处理，包括通知招标人、更新招标信息、处理投标保证金等，并可能会在中标公示或相关招标信息平台上更新中标状态，但这并不等同于发出“废标公告”。

3. 后续招标流程：

   • 中标人弃标后，招标人可以选择重新招标或根据招标文件的规定选择其他中标候选人。如果重新招标，代理公司将按照新的招标流程进行操作。

综上所述，施工单位在中标后发出弃标函，代理公司并不会直接发出废标公告。废标通常是在招标过程中因特定原因导致的，而中标后的弃标是中标人的单方面行为，代理公司会根据相关法律法规和招标文件的规定进行处理。如果用户有进一步的法律问题或需要更详细的解答，请直接向我咨询。