关于您提出的“交通委托合同有违约金合法吗以及怎么赔偿”的问题，以下是我的详细解答：

一、委托合同违约金的合法性

在交通委托合同中，约定违约金是合法的。这种约定体现了合同双方自主约定违约责任的原则，只要该约定是双方真实意思表示，并且不存在违反法律法规强制性规定或导致合同条款无效的其他情形（如欺诈、胁迫、违反公序良俗等），那么约定的违约金条款就是有效的。

二、违约金的赔偿方式

1. 按照合同约定赔偿：

   • 如果交通委托合同中明确约定了违约金的数额或者计算方式，当一方违约时，就应按照合同约定的数额或计算方式进行赔偿。例如，合同约定违约方需支付合同金额的XX%作为违约金，那么违约方就应按此标准赔偿。

2. 请求法院或仲裁机构调整：

   • 如果约定的违约金过高或过低，违约方或受损方可以请求法院或仲裁机构进行调整。调整时，法院或仲裁机构会根据违约行为造成的实际损失、合同的履行情况、当事人的过错程度以及预期利益等综合因素，合理确定违约金的数额。

   • 在请求调整违约金时，需要对实际损失进行举证。实际损失包括直接损失（如因违约导致的额外支出）和间接损失（如因违约而失去的可得利益）。

三、注意事项

1. 违约金的数额应合理：

   • 违约金的数额应当合理，不能过高也不能过低。过高的违约金可能被法院或仲裁机构调整为合理水平，而过低的违约金则可能无法充分补偿受损方的损失。

2. 不能免除法定责任：

   • 交通委托合同中的违约金条款不能免除一方的法定责任或排除对方的主要权利。即使有了违约金约定，违约方仍需承担因其违约行为而产生的其他法律责任。

综上所述，交通委托合同中的违约金是合法的，其赔偿方式应根据合同约定或法院/仲裁机构的裁决来确定。在签订合同时，双方应合理约定违约金的数额和计算方式，并在发生违约时依法主张权利。