在双方感情破裂且已分居两年，满一年后第二次起诉离婚的情况下，法院很可能会判决准予离婚。以下是对此结论的详细解释：
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条的规定，夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。其中，“因感情不和分居满二年”是法定准予离婚的情形之一。
- 该法条还规定，经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
分居时间与感情破裂的认定：
- 在本案例中，双方已分居两年，并且满一年后再次提起离婚诉讼。这符合“因感情不和分居满二年”的法定准予离婚情形，并且也满足了“经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年”的条件。
- 法院在审理时会综合考虑分居时间、感情破裂的程度以及是否有和好的可能等因素。由于已经分居两年且再次起诉，法院通常会认定感情确已破裂，无和好可能。
法院审理流程：
- 在第二次起诉离婚时，法院会依法进行审理。如果法院认为原告提供的证据充分且符合法律规定的离婚条件，那么会判决准予离婚。
- 法院在判决前会进行调解，但调解不是必经程序。如果调解无效，法院会及时作出判决。
综上所述，根据你提供的情况，在双方感情破裂且已分居两年，满一年后第二次起诉离婚的情况下，法院很可能会判决准予离婚。如果你有其他关于离婚纠纷的问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。