合同付款在有效期内是有效的。合同有效期是合同履行的时间框架，它设定了双方基于合同约定享有权利并履行义务的时间范围。付款作为合同履行的重要环节之一，只要符合合同约定的付款条件和方式，在有效期内进行付款是合理且被允许的。
具体来说：
按约定付款：合同中通常会明确规定付款的时间节点、金额、支付方式等具体条款。只要这些条款在合同有效期内被满足，付款行为就是有效的。例如，如果合同约定在货物交付后的一定期限内付款，且货物已在有效期内交付，那么按照约定进行付款就是符合合同规定的。
付款条件成就时需付款：合同中可能存在特定条件作为付款的前提，如工程竣工验收等。当这些条件在合同有效期内达成时，付款义务随即产生，付款方应按时履行付款义务。
因此，在合同有效期内进行付款是合法且有效的。当然，如果合同中对付款有特殊限制或附加条件，如特定审批流程通过后才付款等，那么即使在有效期内，也需满足这些额外条件方可付款。
总之，合同有效期与付款之间存在紧密联系，需依据合同具体条款来判定在有效期内能否付款以及如何付款。如果您在合同付款方面遇到任何问题或疑问，欢迎随时向我咨询。