针对“擅自保存密件怎么处罚”的问题，首先需要明确的是，擅自保存密件属于违反《中华人民共和国保守国家秘密法》的行为。根据该法第五十七条的规定，对于非法获取、持有国家秘密载体的行为，将依法给予处分，并可能有其他相应的法律后果。

具体来说，擅自保存密件的处罚方式主要包括以下几点：

1. 依法给予处分：

   • 根据情节的轻重，相关责任人可能会受到不同程度的行政处分，如警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等。

2. 没收违法所得：

   • 如果擅自保存密件的行为涉及违法所得，那么这些违法所得将被依法没收。

3. 其他法律后果：

   • 如果行为构成犯罪，还将依法追究刑事责任。同时，对于不适用处分的人员，如非公务员或公职人员，保密行政管理部门将督促其所在机关、单位予以处理。

此外，需要强调的是，擅自保存密件不仅可能触犯法律，还会对国家安全造成潜在威胁。因此，建议所有涉及国家秘密的人员都要严格遵守相关法律法规和保密规定，确保国家秘密的安全。

总的来说，擅自保存密件的处罚是严重的，并且会根据情节的轻重以及是否构成犯罪来具体决定。因此，强烈建议相关人员不要擅自保存密件，以免触犯法律并危及国家安全。