违规存储保密信息，通常由市场监督管理部门或相关行业主管部门进行处罚，具体取决于保密信息的性质和违规行为的严重程度。以下是对此问题的详细分析：

1. 市场监督管理部门：

   • 在一般情况下，如果违规存储的保密信息涉及商业秘密或个人隐私，且该行为违反了市场监管相关的法律法规（如《中华人民共和国反不正当竞争法》中关于商业秘密保护的规定），那么市场监督管理部门有权对此类违规行为进行调查和处罚。
   • 处罚措施可能包括警告、罚款、没收违法所得、责令停止违法行为等，具体取决于违规行为的性质和后果。

2. 相关行业主管部门：

   • 如果违规存储的保密信息属于特定行业（如金融、医疗、教育等）的敏感信息，且该行为违反了该行业的相关法律法规或监管要求，那么相关行业主管部门（如银保监会、卫健委、教育部等）将有权对此类违规行为进行处罚。
   • 处罚措施可能包括行业内的警告、罚款、吊销执照、限制业务活动等，具体取决于违规行为的严重程度和行业规定。

3. 法律后果与建议：

   • 违规存储保密信息不仅可能面临行政处罚，还可能引发民事纠纷（如侵犯商业秘密纠纷、隐私权纠纷等），甚至可能构成刑事犯罪（如侵犯商业秘密罪、非法获取计算机信息系统数据罪等）。
   • 因此，建议企业或个人在存储和处理保密信息时，务必遵守相关法律法规和监管要求，建立健全的信息安全管理制度，加强员工的信息安全培训，确保保密信息的安全性和合规性。

若您或您的企业面临违规存储保密信息的法律风险，或有任何关于公司法务方面的疑问，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律建议和解决方案。