在老公出轨但原配没有证据的情况下，通常不能直接申请调查令起诉小三。下面我详细为你解释一下这个问题：

1. 证据的重要性：

   • 在法律诉讼中，证据是认定案件事实的依据。对于出轨这类涉及个人隐私和道德评判的案件，尤其需要确凿的证据来支持主张。
   • 如果没有证据，法院可能因缺乏事实依据而难以支持原配的诉求。

2. 起诉小三的法律依据：

   • 通常情况下，仅依据老公出轨这一情况，难以直接将小三列为被告进行起诉。
   • 如果有相关证据表明小三明知对方有配偶仍与其保持不正当关系，且这种行为给原配造成了一定的损害（如精神创伤、财产损失等），原配可以通过法律途径，以侵犯配偶权等理由对小三提起诉讼。但这类诉讼的举证难度较大。

3. 申请调查令的可行性：

   • 申请调查令通常需要有一定的初步证据或线索，以证明调查的必要性和合理性。
   • 在没有确凿证据的情况下，直接申请调查令可能会面临困难。

4. 建议与行动：

   • 原配可以尝试通过其他合法途径收集证据，如观察配偶与小三的行为表现、寻找知晓情况的证人等。
   • 如果确实无法收集到足够证据，建议原配先与配偶进行沟通，尝试通过协商或调解的方式解决问题。
   • 如果问题无法通过协商解决，且原配认为自己的合法权益受到了严重侵害，可以考虑咨询专业律师，寻求法律帮助。

总之，在老公出轨但原配没有证据的情况下，直接起诉小三通常面临较大困难。建议原配先尝试收集证据，再根据实际情况决定是否采取法律行动。如果你有任何进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。