公务员应休未休年假工资不会取消。具体来说：

1. 法规依据：根据《职工带薪年休假条例》及其实施办法，职工连续工作满12个月以上的，享受年休假。对职工应休未休的年休假天数，单位应当按照该职工日工资收入的300%支付年休假工资报酬。这一规定同样适用于公务员，因为公务员也属于职工范畴，且相关法规并未对公务员的年休假工资作出特别规定。

2. 实际情况：在实际操作中，公务员如因工作原因未能休满年休假，其应休未休的年休假工资会按照相关规定进行发放，不会被取消。这是保障公务员合法权益的重要措施之一。

3. 特殊情况：当然，也存在一些特殊情况，如公务员因个人原因主动放弃年休假或者因违纪违规被取消年休假资格等，这些情况下可能不涉及年休假工资的发放。但这些都是特殊情况，与一般情况下的应休未休年假工资发放无关。

综上所述，公务员应休未休年假工资不会取消，这是由相关法规规定和实际情况所决定的。如果公务员在年休假方面遇到任何问题，可以及时向单位人事部门咨询或寻求法律援助。