当门店合同和法人不一致时，办理营业执照需要特别注意一些关键步骤和法律规定。以下是我为您提供的详细解答：
一、明确概念区别
首先，我们需要明确“营业执照的名称”与“法人代表的名称”之间的区别。营业执照是工商行政管理机关发给工商企业、个体经营者的准许从事某项生产经营活动的凭证，其名称通常指的是企业名称或个体工商户名称。而法人代表则是依法代表法人行使民事权利，履行民事义务的主要负责人，其名称通常指的是个人的姓名。
二、合同主体与营业执照一致性要求
在签订门店合同时，合同主体应当与营业执照上的名称保持一致。如果合同主体与营业执照上的名称不一致，可能会引发法律纠纷和行政处罚。因此，在办理营业执照时，需要确保合同主体与营业执照上的名称完全相符。
三、处理门店合同和法人不一致的情况
变更营业执照：
- 如果门店合同上的名称与营业执照上的名称不一致，且该门店是以法人代表以外的其他人的名字注册的，那么首先需要变更营业执照上的名称，使其与合同主体一致。
- 变更营业执照需要按照当地工商行政管理部门的规定提交相关材料，并办理变更手续。
签订补充说明：
- 在变更营业执照后，如果与商场或其他合作方已经签订了合同，且合同中的名称与变更后的营业执照名称不一致，那么需要与商场签订一个补充说明，明确合同主体已经变更，并确认合同的继续有效性。
- 补充说明应当明确双方的权利义务，避免因为名称变更而产生的法律纠纷。
法律合规性审查：
- 在处理门店合同和法人不一致的情况时，建议咨询专业的法律顾问或律师，对合同的合规性进行审查，确保合同内容符合《中华人民共和国民法典》等相关法律法规的规定。
四、注意事项
- 及时办理变更手续：一旦发现门店合同和法人不一致，应尽快办理营业执照的变更手续，以避免可能的法律风险和行政处罚。
- 保留相关证据：在办理变更手续和签订补充说明的过程中，应保留好相关证据和文件，以备不时之需。
- 加强内部管理：企业应加强对门店合同和营业执照的管理，确保两者的名称和主体保持一致，避免类似问题的再次发生。
综上所述，当门店合同和法人不一致时，需要按照相关法律法规和规定办理营业执照的变更手续，并与合作方签订补充说明以确认合同的继续有效性。同时，企业应加强内部管理，确保合同和营业执照的合规性和一致性。