就业协议盖人力资源部的章，在特定情况下是可以的，但原则上应加盖用人单位的公章或人事部门公章。以下是对这一问题的详细分析：

1. 原则上的要求：

   • 就业协议作为毕业生、用人单位和学校三方之间的法律约定，应确保其法律效力的严谨性。
   • 原则上，应加盖能代表用人单位的公章或人事部门公章，以体现用人单位的正式意志和承担相应法律责任的能力。

2. 特殊情况下的考虑：

   • 如果用人单位的部门章被正式授权可以代表单位签署就业协议，并且这一做法符合当地相关法律法规的规定，那么盖部门章在法律上也是可以被接受的。
   • 但这种情况下，必须确保部门章具有法律效力，且用人单位已明确授权该部门章可以代表单位签署就业协议。

3. 实际操作中的建议：

   • 为避免未来可能出现的纠纷，建议在签署就业协议之前，先与用人单位的人力资源部门或法务部门进行沟通，明确他们可以接受的盖章方式。
   • 如果用人单位要求加盖公章或人事部门公章，应严格按照要求执行，以确保协议的法律效力。

4. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同由用人单位与劳动者协商一致，并经用人单位与劳动者在劳动合同文本上签字或者盖章生效。虽然就业协议与劳动合同在性质上有所不同，但同样应遵循法律对于合同效力的一般规定。

综上所述，就业协议在签署时，应优先考虑加盖用人单位的公章或人事部门公章。但在特定情况下，如部门章被正式授权且符合法律法规要求，盖部门章也是可以的。为确保协议的有效性和避免纠纷，建议在签署前与用人单位明确盖章要求。