不可以。劳动合同是与总公司签订的，通常代表着你与总公司之间的劳动关系。而工作证明是用于证实你在某个公司或机构的任职情况和工作表现的文件。因此，开具工作证明时，应当加盖与你存在劳动关系的公司的印章，即总公司的印章。

从法律角度来看，分公司虽然可能属于总公司的下属机构，但在法律上，分公司和总公司是两个不同的实体。分公司的印章只能代表分公司自身的行为，而不能代表总公司的行为。因此，如果你在总公司工作，但工作证明上加盖的是分公司的印章，这可能会在法律上产生歧义，甚至可能被视为伪造文件。

总的来说，为了确保工作证明的真实性和合法性，你应当要求加盖与你存在劳动关系的公司（即总公司）的印章。如果你在这方面遇到任何问题或困惑，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。