一个零售店铺有两家公司员工并不直接构成违法。这种情况是否违法，主要取决于两家公司之间以及它们与员工之间的具体法律关系、合同约定，以及实际运营中是否遵守了相关法律法规。以下是对这一问题的详细分析：
公司架构与员工关系：
- 如果两家公司是独立的法人实体，各自拥有不同的员工，且这些员工在各自的公司名下工作，那么这种情况在法律上是允许的。员工可以同时为两家或多家公司提供服务，只要这种服务不违反任何一家公司的规章制度或合同约定。
- 如果两家公司之间存在关联关系（如母子公司、兄弟公司等），并且员工在关联公司之间的工作安排是合法的，那么这种情况也是合法的。
劳动合同与兼职：
- 员工与每家公司都应签订正式的劳动合同，明确双方的权利和义务。如果员工在两家公司都签订了合法的劳动合同，并且没有违反任何一家公司的合同规定，那么这种兼职行为是合法的。
- 需要注意的是，如果员工在一家公司的工作时间、工作内容等与在另一家公司的安排产生冲突，或者违反了某家公司的保密协议、竞业禁止等规定，那么可能会构成违约或违法。
法律法规遵守：
- 在实际运营中，两家公司和员工都需要遵守相关法律法规，如劳动法、税法等。如果两家公司或员工存在违法违规行为，如未按时缴纳社会保险、偷税漏税等，那么将会受到法律的制裁。
综上所述，一个零售店铺有两家公司员工并不直接构成违法，但前提是两家公司和员工都需要遵守相关法律法规和合同约定。如果在实际运营中遇到任何问题或纠纷，建议及时咨询专业律师以获取法律帮助。