当原判决被司法机关改变后，处理依据主要是相关法律法规以及司法解释中关于审判监督程序、上诉、抗诉等规定。具体来说：

1. 审判监督程序：

   • 如果原判决在生效后，发现有新的证据足以推翻原判决，或者原判决适用法律确有错误，又或者审判程序存在严重违法等情形，司法机关可以依法启动审判监督程序，对原判决进行再审。
   • 再审过程中，司法机关将依据新的证据、适用的法律以及审判程序的规定，对原判决进行全面审查，并作出新的判决。

2. 上诉与抗诉：

   • 在一审判决后，当事人如果不服，可以在法定期限内向上级法院提起上诉。上级法院将依据上诉理由和相关法律，对一审判决进行审查，并作出维持、改判或者撤销原判发回重审的裁定。
   • 检察机关如果认为原判决存在错误，也可以依法提起抗诉，要求法院对原判决进行重新审理。

3. 法律依据：

   • 《中华人民共和国刑事诉讼法》等相关法律法规中，对审判监督程序、上诉、抗诉等制度进行了详细规定，为司法机关改变原判决提供了明确的法律依据。

4. 处理原则：

   • 司法机关在改变原判决时，必须严格遵循法律程序，确保公正、公平、公开。
   • 改变原判决必须基于充分的证据和理由，不能随意变更。
   • 当事人对改变后的判决仍然不服的，可以依法通过上诉、申诉等途径寻求救济。

综上所述，原判决被司法机关改变后的处理依据主要是相关法律法规以及司法解释中关于审判监督程序、上诉、抗诉等规定。这些规定确保了司法机关在改变原判决时有明确的法律依据和程序可循，同时也保障了当事人的合法权益。