集体单位厂房无证买卖是不合法的，其买卖合同可能无效。下面我从法律角度为您详细分析：

一、合同效力分析

根据《民法典》第一百四十三条的规定，一个有效的民事法律行为需要满足以下条件：

1. 行为人具有相应的民事行为能力；
2. 意思表示真实；
3. 不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。

对于集体单位厂房的无证买卖，由于该厂房未取得合法的证件，其产权存在瑕疵。在这种情况下，即便买卖双方签订了买卖合同，该合同也可能因违反法律、行政法规的强制性规定而被认定为无效。

二、法律风险分析

无证房产买卖存在诸多法律风险，具体包括：

1. 产权争议风险：未取得房产证的房产，其产权可能存在争议。买家在购买后可能面临原产权人债务纠纷导致房产被查封或执行的情况，权益难以保障。
2. 无法过户风险：无法办理产权过户手续，房产无法正式登记在买家名下。这意味着买家不能取得完整的产权，后续可能面临房产被他人主张权利的风险。
3. 合同无效风险：如前所述，此类买卖合同可能因违反法律强制性规定而被认定无效。一旦合同无效，买家将无法通过法律途径有效维权。

三、法律建议

针对集体单位厂房无证买卖的情况，我建议您：

1. 谨慎购买：在购买前务必核实房产的产权情况，确保房产具有合法的证件和清晰的产权归属。
2. 咨询专业意见：如有任何疑问或不确定的地方，应及时咨询专业律师或房地产专家，以获取准确的法律意见和风险评估。
3. 选择正规渠道：尽量通过正规渠道购买房产，避免涉及无证房产买卖等高风险行为。

综上所述，集体单位厂房无证买卖是不合法的，其买卖合同可能无效。在购买房产时，请务必谨慎并咨询专业意见，以确保您的合法权益得到保障。