是否算逾期，主要取决于贷款合同的具体约定以及银行或贷款机构的实际操作。以下是详细分析：

1. 合同约定优先：首先，需要查看贷款合同中关于还款日期的具体约定。如果合同中明确规定还款日期为每月的1号，且未明确说明具体的扣款时间，那么理论上只要是在1号当天完成还款，就不应被视为逾期。然而，如果合同中有特别条款规定了具体的扣款时间（如晚上12点前），则必须在该时间前完成还款，否则可能会被视为逾期。

2. 银行或贷款机构的实际操作：其次，银行或贷款机构的实际扣款时间也是决定因素之一。即使合同中没有明确规定扣款时间，但银行或贷款机构通常会在某个时间点进行批量扣款。如果二号凌晨扣款是银行或贷款机构的常规操作，且这一操作在业内被广泛接受，那么在这种情况下，一号晚上打钱二号凌晨扣款通常不会被视为逾期。但为了避免不必要的纠纷，建议借款人提前与银行或贷款机构确认扣款时间，并确保在扣款前完成还款。

3. 建议与措施：为了避免因扣款时间问题导致的逾期风险，建议借款人：

   • 仔细阅读贷款合同，了解关于还款日期的具体约定；
   • 提前与银行或贷款机构沟通确认扣款时间；
   • 尽量在还款日前一天或更早时间将资金转入还款账户，以确保资金充足且能及时扣款；
   • 如遇特殊情况可能导致逾期，及时与银行或贷款机构联系并说明情况，争取宽限期或避免逾期记录的产生。

综上所述，一号还贷款一号晚上打钱二号凌晨扣款是否算逾期，需根据贷款合同的具体约定以及银行或贷款机构的实际操作来判断。为确保自身权益，建议借款人提前了解并遵守相关规定。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。