在个人合伙纠纷账目不清的情况下，进行司法审计是一个关键步骤，双方需要提供的资料主要包括以下几类：
基础资质证明：包括营业执照、其他相关资质证明等，这些资料用于确认合伙企业的合法性和经营资质。
合同协议：提供合伙协议、服务协议、成本费用协议、借款合同、租赁合同、投资合同等重要经济合同。这些合同是审计过程中了解合伙业务内容和经济往来的重要依据。
财务资料：
- 会计报表：包括资产负债表、利润表、现金流量表等，这些报表反映了合伙企业的财务状况和经营成果。
- 辅助余额表：包括应收/应付/其他应收/其他应付/预收/预付等所有往来明细，用于核对合伙企业的债权债务情况。
- 固定资产明细清单及折旧明细表：包含原值、净残值、使用年限、开始使用日期等内容，用于了解合伙企业的固定资产状况。
- 电子资料：包括会计报表、明细账、科目余额表、固定资产、长期待摊、无形资产明细清单等，这些电子资料便于审计机构进行高效、准确的审计。
税务资料：提供所得税纳税申报表、税费缴款凭证、增值税申报表主表及相关附加税纳税申报表、税费缴纳凭证等，这些资料用于核实合伙企业的税务缴纳情况。
其他相关资料：
- 存货盘点表、固定资产盘点表（需盘点个人及监盘人、财务人员签名），用于确认合伙企业的存货和固定资产的实际数量和价值。
- 银行对账单及调节表，用于核对合伙企业的银行账户交易记录和余额。
- 车辆、房产等重要资产的所有权证明，用于确认这些资产的所有权归属。
- 减免税证明文件、重大诉讼资料、重要批文等文件，这些资料可能对审计结果产生影响，因此需要一并提供。
综上所述，个人合伙纠纷账目不清时，双方应尽可能提供全面、真实的资料给审计机构，以便审计机构能够准确、客观地发表审计意见，为解决合伙纠纷提供有力依据。如果双方在提供资料方面存在困难或争议，应及时沟通并协商解决，或寻求专业律师的帮助和指导。