在单位是否可以与自己母亲的公司合作，这个问题并没有一个绝对的答案，它取决于具体的情境和条件。
首先，我们要明确的是，法律本身并没有直接禁止员工与自己亲属（包括母亲）的公司进行合作。但是，这种合作是否可行，需要考虑以下几个方面：
公司规章制度：
- 很多公司都有关于员工与外部公司合作或进行利益输送的规章制度。你需要首先查阅你所在公司的相关规章制度，看是否有明确的禁止性规定。
- 如果公司规章制度中明确禁止了员工与特定关联方（如直系亲属的公司）进行合作，那么这种合作就是不可行的，否则可能会面临公司的纪律处分。
合作性质与透明度：
- 合作的性质和内容也是重要的考虑因素。如果合作是公开、透明且符合商业逻辑的，那么可能更容易被接受。
- 相反，如果合作存在隐蔽性、不公平性或可能引发利益冲突，那么就需要更加谨慎地考虑。
法律与道德风险：
- 尽管法律上没有直接禁止，但你需要评估这种合作是否可能涉及法律或道德风险。例如，是否可能构成不正当竞争、侵犯商业秘密或违反其他法律法规。
- 同时，你也需要考虑这种合作是否会对你的职业声誉和未来发展产生负面影响。
公司文化与氛围：
- 公司的文化和氛围也会对这种合作的接受度产生影响。如果公司鼓励开放、合作和创新的氛围，那么这种合作可能更容易被接受。
- 相反，如果公司文化比较保守或对这种合作持谨慎态度，那么你就需要更加谨慎地考虑。
综上所述，在单位是否可以与自己母亲的公司合作，需要综合考虑多个因素。我建议你首先查阅公司规章制度，了解公司的具体要求和限制。如果公司规章制度没有明确禁止，那么你需要进一步评估合作的性质、透明度以及可能涉及的法律和道德风险。在任何情况下，保持透明和诚信都是非常重要的。如果你有任何具体的疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。