事业编服务期20万违约金是否合法，需根据具体情况判断。

首先，根据《劳动合同法》的相关规定，除第二十二条（服务期约定）和第二十三条（竞业限制约定）规定的情形外，用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。这意味着，在大多数情况下，事业单位与劳动者在聘用合同中约定违约金是不合法的。

然而，也存在特殊情况。如果事业单位为劳动者提供了专项培训费用，并进行了专业技术培训，那么根据《劳动合同法》第二十二条的规定，事业单位可以与劳动者订立协议，约定服务期。在这种情况下，如果劳动者违反服务期约定，是需要按照约定向用人单位支付违约金的。但违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用，且不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。

因此，对于事业编服务期20万违约金是否合法的问题，我们需要具体查看聘用合同中的条款以及是否存在上述特殊情况。如果合同中的违约金约定不符合《劳动合同法》的规定，那么该约定是无效的，劳动者无需支付违约金。如果合同中的违约金约定符合《劳动合同法》的规定，那么劳动者在违反服务期约定时，可能需要按照约定支付违约金，但违约金的数额应受到法律的限制。

总之，事业编服务期违约金的合法性需要根据具体情况来判断，建议劳动者在签订聘用合同时仔细审查合同条款，并在有疑问时咨询专业律师。