对账函盖合同章通常是有效的。以下是对这一结论的详细解释：

1. 合同章的法律效力：

   • 合同章代表着公司签订合同等相关民事行为的能力。当它加盖在对账函上时，能在一定程度上表明公司对对账函内容的认可。
   • 法律上，只要盖章是真实的，并且对账函所记录的内容与双方的实际交易情况相符，那么这份对账函就可以作为证明双方债权债务关系等事实的有效证据。

2. 实践中的情况：

   • 在实际操作中，如果双方在以往的交易中明确规定，只有加盖公章才对某项行为产生效力，那么仅盖合同章的对账函可能会存在效力上的问题。但这种情况需要具体看双方的约定。
   • 如果没有特殊约定，对账函盖合同章通常能发挥证明作用，具备相应法律效力。一旦后续发生纠纷，这份对账函可以作为重要的证据使用。

3. 举例说明：

   • 假设两家公司有业务往来，交易结束后形成对账函。如果其中一家公司在对账函上加盖了合同章，而双方之前没有特殊约定必须加盖公章，那么这份对账函在法律上通常是被认为有效的。它可以作为证明双方交易情况和债权债务关系的证据。

综上所述，对账函盖合同章在大多数情况下是有效的。但具体效力还需根据双方的约定和实际情况来判断。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。