在合同期内离职扣工资一般情况下是不合法的，但也存在某些特殊法定情形使得扣工资行为变得合法。下面我将详细解释这一结论：
一、一般情况下的不合法性
法律依据：
- 根据《劳动法》第五十条，工资应当按月支付给劳动者，且不得克扣或无故拖欠。
- 《劳动合同法》第三十七条也明确，劳动者提前三十日（试用期提前三日）书面通知用人单位，可以解除劳动合同，单位通常无权因此克扣工资。
实例说明：
- 如果劳动者依法提前通知离职，而用人单位无故扣工资，这侵犯了劳动者获得劳动报酬的权利，属于违法行为。
二、特殊情况下的合法性
劳动者因自身过错给单位造成经济损失：
- 若劳动者故意或重大过失给用人单位造成损失，单位可按劳动合同约定要求赔偿，但从工资中扣除的部分不得超过当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。
双方在劳动合同中有合法合规的特别约定：
- 如约定了服务期和违约金，或专项培训后的服务期及费用分摊等，只要这些约定不违反法律法规，单位按约定扣除相应费用是合法的。
三、劳动者应对建议
- 了解权益：劳动者应熟悉劳动合同和相关法律法规，确保自己的合法权益不受侵害。
- 协商解决：如遇扣工资情况，先与用人单位协商解决，要求说明扣款依据。
- 投诉举报：协商不成时，可向劳动监察部门投诉（电话：12333）或申请劳动仲裁。
- 保留证据：劳动者应保留好劳动合同、工资条、离职证明等相关证据，以备不时之需。
综上所述，合同期内离职扣工资的行为在大多数情况下是不合法的，但也存在特殊情况。劳动者在离职前应仔细审查劳动合同和相关法律法规，确保自己的合法权益不受侵害，并在离职过程中积极配合单位完成相关工作，妥善保管好相关证据材料。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。