车辆道路运输证每年年审公司没有在证件上盖章，并不直接决定其合法性，需结合具体情况分析。
一般情况下的要求：
- 车辆道路运输证是车辆从事道路运输的合法凭证，年审是对其运输资质和车辆状况的定期审核。
- 通常情况下，年审合格后，相关部门会在证件上加盖印章或发放新的合格证明，以确认车辆的合法运输资格。
未盖章的可能情况与合法性分析：
- 免检或电子化管理：随着交通管理部门的电子化改革，部分车辆可能享受免检政策或已实现电子化管理，此时可能不再需要在纸质证件上盖章。若车辆属于此类情况，且已按要求完成电子年审流程，则未盖章不影响其合法性。
- 工作人员疏忽或系统故障：若因车管所工作人员疏忽或系统故障导致未盖章，车主可凭相关证明文件向车管所申请补盖或更正。在这种情况下，未盖章并非车主过错，且不影响车辆的合法运输资格。
- 未按规定年审：若车辆未按规定进行年审，或年审不合格而未获得盖章，则车辆不具备合法运输资格。此时上路运输将违反相关法律法规，可能面临处罚。
法律建议与后果：
- 车主应密切关注车辆道路运输证的年审要求，确保按时、按规定完成年审流程。
- 若发现证件未盖章，应及时与车管所联系，了解具体情况并申请补盖或更正。
- 若因未按规定年审或年审不合格而导致证件无效，车主应暂停运输活动，直至完成年审并获得合法证明。
- 违反相关法律法规的，将可能面临罚款、扣分、扣留车辆等处罚措施。
综上所述，车辆道路运输证每年年审公司没有在证件上盖章，并不直接决定其合法性。车主应了解具体情况，确保车辆具备合法运输资格，并遵守相关法律法规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。