当三轮车在事故中被认定为机动车时，处理流程与赔偿事宜会遵循一系列法律规定和程序。以下是对此情况的详细解答：
一、事故处理流程
确保安全与紧急救助：
- 若有人员受伤，应立即拨打120急救电话，并尽量不移动伤者，以免造成二次伤害。
- 同时，应确保现场安全，将车辆移至不妨碍交通的地点（如果可能），并打开危险警示灯，放置三角警示标志。
报警与现场保护：
- 立即拨打122交通事故报警电话，报告事故详情。
- 保护事故现场，避免破坏痕迹和物证。若需移动车辆，应先拍照或录像记录。
交警调查与责任认定：
- 交警会进行详细调查，包括询问驾驶员、查看现场、收集证据等。
- 根据调查结果，交警将作出事故责任认定，明确各方责任。
二、赔偿处理
确定赔偿责任主体：
- 赔偿责任主体包括驾驶员、车主及保险公司（如果车辆投保）。
- 若三轮车被认定为机动车，但未投保交强险或商业险，驾驶员和车主需自行承担相应赔偿责任。
交强险与商业险赔偿：
- 如果三轮车投保了交强险，保险公司将在责任限额内进行赔偿。
- 若投保了商业险，超出交强险限额的部分将由商业险按事故责任比例赔偿。
协商或诉讼赔偿：
- 事故双方可协商赔偿事宜，达成一致后签订赔偿协议并履行。
- 若无法协商一致，可向人民法院提起民事诉讼，由法院根据事故责任认定和相关法律法规判决赔偿金额和方式。
三、特殊注意事项
电动三轮车的管理与法律适用：
- 目前我国电动三轮车的管理实践与相关法律法规存在脱节。虽然电动三轮车被认定为机动车，但在交强险投保、车辆登记、年检等方面仍存在滞后状态。
- 因此，在处理涉及电动三轮车的事故时，需考虑这些特殊情况，并咨询专业律师以获取更准确的法律建议。
保持冷静与理智：
- 在处理事故过程中，务必保持冷静和理智，不要轻信对方言辞或承诺，也不要随意签署文件或协议。
寻求法律援助：
- 如需法律咨询或援助，应及时联系专业律师，以保护自身合法权益。
综上所述，当三轮车在事故中被认定为机动车时，应遵循上述处理流程和赔偿规定。同时，考虑到电动三轮车的特殊管理情况，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。