在电动三轮车被认定为机动车并发生事故的情况下，赔偿的处理需要遵循一系列法律程序和责任划分原则。以下是一个详细且有条理的解答：
一、事故现场处理
立即停车并保护现场：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》的规定，发生交通事故后，车辆驾驶人应立即停车，保护现场，避免二次伤害。
- 在车辆后方适当距离（普通道路50-100米，高速公路150米以外）放置三角警示牌，以警示其他车辆。
- 检查现场安全，如有伤员应立即拨打120急救电话，并在必要时移动伤员时标明位置。
报警并等待交警处理：
- 迅速拨打122交通事故报警电话，报告事故发生的时间、地点和大致情况。
- 等待交警到场处理，特别是当事故造成伤亡或重大财产损失时，必须等待交警进行现场勘查和调查。
二、责任认定
配合交警调查：
- 如实向交警陈述事故经过，提供准确信息，不得隐瞒或谎报。
- 交警会根据现场勘查、调查结果及检验鉴定结论，在规定时间内出具交通事故责任认定书。
责任划分：
- 责任认定书会明确划分双方的责任，包括全部责任、主要责任、同等责任、次要责任和无责任。
- 这将作为后续赔偿处理的重要依据。
三、保险理赔
通知保险公司：
- 如果电动三轮车购买了保险（如交强险），应及时通知保险公司，并告知事故情况。
提交理赔材料：
- 根据保险公司的要求，准备并提交相关理赔材料，如事故认定书、医疗证明、费用清单等。
- 确保材料真实完整，以便保险公司能够顺利处理理赔申请。
协商理赔：
- 与保险公司沟通理赔事宜，了解理赔进度和结果。
- 如果对保险公司的理赔决定有异议，可以提出申诉或寻求法律援助。
四、赔偿协商与处理
协商赔偿：
- 根据责任认定书，双方可以协商赔偿范围，可能包括医疗费、误工费、护理费、营养费、残疾赔偿金等。
- 协商时应保持理性，尽量达成双方都能接受的赔偿协议。
调解与诉讼：
- 如果协商不成，可以申请交警部门或人民调解委员会进行调解。
- 调解无果时，任何一方可以向有管辖权的人民法院提起民事诉讼，提交相关证据支持自己的诉求。
五、特殊情况处理
- 无牌无证驾驶：如果电动三轮车未悬挂机动车号牌或未放置相关标志，公安机关交通管理部门有权扣留车辆。
- 法律责任：无牌无证驾驶属于违法行为，将依法受到处罚。在处理事故时，除了承担事故责任外，还需同时承担此违法责任。
结论与建议
电动三轮车被认定为机动车并发生事故时，赔偿的处理需要严格遵循法律程序和责任划分原则。建议当事人在处理事故时保持冷静，立即停车保护现场，及时报警并配合交警调查。在责任认定明确后，应依法进行保险理赔和赔偿协商。如果遇到特殊情况或难以解决的问题，建议寻求法律援助或咨询专业律师以维护自身合法权益。