当交通事故中的三轮车经鉴定被认定为机动车后，其赔偿问题需结合相关法律法规及司法实践来综合分析。以下是对此问题的详细解答：
一、车辆性质认定
首先，需要明确的是，根据《中华人民共和国道路交通安全法》第一百一十九条的规定，车辆被划分为机动车与非机动车两类。电动三轮车，若其设计最高时速、空车质量、外形尺寸等不符合非机动车的相关标准，则会被认定为机动车。这一认定通常由公安机关交通管理部门在交通事故责任认定书中明确。
二、交强险赔偿问题
交强险投保现状：
- 目前，我国电动三轮车在车辆登记、年检、驾驶证照管理以及交强险保险业务等方面仍处于滞后状态。社会管理层面上并未强制要求电动三轮车投保交强险，且实际上电动三轮车往往无法投保交强险。
司法实践中的处理：
- 根据《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第十六条，未依法投保交强险的机动车发生交通事故造成损害，当事人请求投保义务人在交强险责任限额内予以赔偿的，人民法院应予支持。但这一规定在电动三轮车无法投保交强险的客观情况下，其适用性存在争议。
- 在司法实践中，法院通常会考虑电动三轮车所有人及驾驶人因不可归责于自身的原因而未给车辆投保交强险，因此不会判决其承担交强险责任限额内的全部赔偿责任。相反，法院会按照责任比例来划分赔偿责任。
三、责任比例划分
法律依据：
- 《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条及地方性法规（如《江苏省道路交通安全条例》第六十八条）对道路交通事故纠纷中各方责任比例的划分作出了明确规定。
责任划分原则：
- 在机动车与非机动车发生交通事故时，通常会适度减轻非机动车一方的赔偿责任。这是因为机动车作为高速运载工具，其运行显著提升了周围环境的危险程度，机动车驾驶人应承担更高的注意义务。
- 当电动三轮车被认定为机动车后，若与另一机动车发生交通事故，则双方的责任比例将按照机动车之间的交通事故来划分。
四、具体赔偿案例
以您提供的案例为例：
案例一：朱某驾驶普通二轮摩托车与王某驾驶的无号牌电动三轮车发生碰撞。交警部门认定双方负同等责任。由于王某的电动三轮车被认定为机动车且未投保交强险，但法院考虑其无法投保的客观情况，判决王某对朱某的损失承担50%的赔偿责任。
案例二：李某驾驶电动三轮车与王某骑行的自行车发生碰撞。交警部门认定李某负主要责任。同样，由于李某的电动三轮车被认定为机动车且未投保交强险，法院判决李某按事故责任比例（如70%或根据具体案情确定）赔偿王某的损失，而非在交强险限额内先行赔付。
五、建议与提醒
- 遵守交通法规：无论是电动三轮车车主还是其他机动车驾驶员，都应严格遵守交通法规，确保行驶过程中的合法合规。
- 了解车辆性质：在购买和使用电动三轮车时，应了解其车辆性质及相关法律法规要求，避免因不了解规定而引发不必要的法律纠纷。
- 及时投保：尽管目前电动三轮车投保交强险存在困难，但车主仍应关注相关政策动态，一旦条件允许，应及时为车辆投保以保障自身和他人的合法权益。
综上所述，当交通事故中的三轮车经鉴定被认定为机动车后，其赔偿问题需结合车辆性质认定、交强险投保现状、责任比例划分以及具体赔偿案例来综合分析。在司法实践中，法院通常会考虑电动三轮车无法投保交强险的客观情况，并按照责任比例来划分赔偿责任。