企业扣基本工资是否合法，取决于扣工资的具体原因和方式是否符合法律法规的规定。以下是一些具体情况的分析：
合法扣工资的情形：
- 代扣个人所得税：根据税法规定，用人单位有义务从员工工资中代扣代缴个人所得税。
- 代扣社会保险费用：包括养老保险、医疗保险、失业保险等，这些费用由用人单位和个人共同承担，单位有权从员工工资中代扣个人应缴纳的部分。
- 法院判决或裁定要求代扣的抚养费、赡养费等：如果员工需要支付这些费用，且法院已作出判决或裁定，用人单位可以依法代扣。
- 因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的赔偿：根据《工资支付暂行规定》第十六条，用人单位可按照劳动合同的约定要求劳动者赔偿经济损失，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
- 违反公司规章制度或劳动纪律的罚款：如果公司的规章制度明确规定了对某些违规行为的处罚措施，并且该制度经过民主程序制定并公示，用人单位可以根据规定对员工进行罚款，但罚款的金额和方式必须合理。
不合法扣工资的情形：
- 无故克扣员工基本工资，没有合法依据或未按照法律规定程序进行。
- 扣工资超过法律规定的限额，如因劳动者原因造成损失而扣工资时，超过了当月工资的20%或扣除后剩余工资低于当地最低工资标准。
- 以其他非法理由扣工资，如因员工请假做产检等合法行为而扣工资。
综上所述，企业扣基本工资并非一概而论地合法或不合法，而是需要根据具体情况来判断。如果企业有合法依据并按照规定程序进行扣工资，则是合法的；否则，就是不合法的。如果您遇到企业扣工资的情况，建议首先了解扣工资的具体原因和依据，然后咨询专业律师或相关部门进行维权。