公司股东名册办理了登记但是外部未办理登记，一般不能对抗善意第三人。下面我来详细解释一下这个问题：

首先，我们要明确股东名册的作用。股东名册是记载公司股东及其所持股份的法定文件，是公司确认股东身份、股东行使股东权利的重要依据。然而，股东名册的登记主要在公司内部产生法律效力，对于公司外部的第三人来说，并不一定具有直接的对抗效力。

接下来，我们分析“外部未办理登记”的含义。这通常指的是在公司登记机关（如工商行政管理部门）的登记事项中，并未将相关股东信息或股权变动情况进行公示。由于公司登记具有公示公信的效力，外部第三人往往依赖这些公示信息来判断公司的股东结构和股权状态。

现在，我们结合这两个方面来探讨原问题。如果公司仅在股东名册上进行了登记，但并未在外部进行相应的登记公示，那么对于善意第三人来说，他们可能并不知晓公司内部的股权变动情况。在这种情况下，如果善意第三人基于对公司公示信息的信任而与公司进行交易，那么他们有权主张自己作为善意第三人的合法权益。

因此，从法律角度来看，公司股东名册的登记虽然重要，但并不能完全替代外部登记公示的作用。在公司经营过程中，为了确保交易的稳定性和安全性，公司应当及时、准确地在相关登记机关进行股权变动等信息的公示。

综上所述，公司股东名册办理了登记但外部未办理登记时，一般不能对抗善意第三人。如果你在这方面有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。