是的，水土保持补偿费逾期未申报是会受到处罚的。

根据《中华人民共和国水土保持法》的相关规定，对于拒不缴纳水土保持补偿费的行为，县级以上人民政府水行政主管部门会责令限期缴纳。如果逾期仍不缴纳，那么从滞纳之日起，会按日加收滞纳部分万分之五的滞纳金，并且可以处以应缴水土保持补偿费三倍以下的罚款。这一规定明确了逾期不缴纳水土保持补偿费的法律后果，旨在确保水土保持补偿费的及时缴纳，以促进水土保持工作的顺利进行。

此外，从实际的行政处罚案例来看，如安徽万创发展置业有限公司因未缴纳水土保持补偿费而受到的处罚，不仅被要求补缴本金和加收滞纳金，还被处以了罚款。这进一步印证了逾期未申报水土保持补偿费是会受到实际处罚的。

因此，建议相关单位和个人应按时申报并缴纳水土保持补偿费，以避免不必要的法律后果。如果因特殊原因无法按时缴纳，应及时与水行政主管部门沟通并寻求解决方案。