未缴纳水土保持费存续时间达到3年，仍可能被立案查处。具体分析如下：

1. 法律依据与追责时效
   根据《中华人民共和国水土保持法》第五十七条，未按规定缴纳水土保持补偿费的，由县级以上人民政府水行政主管部门责令限期缴纳；逾期不缴纳的，自滞纳之日起按日加收滞纳金，并可处应缴费用3倍以下的罚款。
   法律未明确规定行政处罚的追责时效期限（与刑事追诉时效不同），行政机关对违法行为原则上可随时启动调查和处罚程序，只要违法行为处于持续状态（如长期未缴纳费用）。

2. “存续时间3年”的影响

   • 持续违法性：若3年内未缴纳费用且未补缴，违法行为持续存在，行政机关有权立案查处。
     
   • 滞纳金与罚款：逾期缴纳期间会按日加收滞纳金，且可能面临更高比例的罚款（如应缴费用的1-3倍）。
     
   • 例外情形：若行政机关已通过催告、通知等方式要求补缴，但当事人仍拒不履行，可能构成“拒不执行行政决定”，面临更严厉的处罚或强制执行。

3. 实务建议

   • 主动补缴：尽快联系当地水行政主管部门补缴费用及滞纳金，避免罚款和信用记录受损。
     
   • 协商处理：若存在经济困难，可申请分期缴纳或减免滞纳金（需符合地方政策）。
     
   • 法律风险：长期不缴纳可能导致行政处罚、强制执行（如冻结账户、划拨财产），甚至影响企业征信或个人信用。

总结：3年未缴纳水土保持费不影响立案查处，行政机关仍有权追责。建议立即处理以降低法律风险。如有具体案件细节，可进一步向我咨询。