在非法放贷刑事案件中，关于已经退赔的财物是否还应当扣押没收违法所得，这是一个涉及刑事法律执行与财产处理的问题。以下是我的详细解答：

核心结论：一般情况下，若非法放贷的违法所得已经主动退赔给受害者，且退赔行为得到了执法机关的确认，那么执法机关通常不会再对该部分财物进行扣押或没收。但若退赔不彻底或存在其他特殊情况，执法机关有权根据具体情况决定是否采取进一步措施。

分析说明：

1. 主动退赔的意义：

   • 主动退还非法所得是违法者弥补受害者损失的行为，体现了违法者的悔过态度。
   • 当违法者已将非法所得退还，且该财物已脱离其控制并回归应有的状态（如归还给受害者），执法机关再进行没收已无实际意义。

2. 执法机关的处理原则：

   • 执法机关在处理非法所得时，会依据《中华人民共和国刑法》及相关司法解释的规定，对违法所得进行追缴或责令退赔。
   • 若违法者已主动退赔，且退赔金额与违法所得相符，执法机关通常会认可该退赔行为，并据此终止对相应财物的进一步处理。

3. 特殊情况的处理：

   • 若退赔不彻底，即违法者未完全退还所有违法所得，或退赔行为未得到有效确认（如受害者未收到退赔或退赔金额存在争议），执法机关有权根据具体情况决定是否继续采取没收等措施。
   • 在某些情况下，即使违法者已退赔部分违法所得，但执法机关认为仍有必要对剩余部分或相关财物进行扣押或没收，以维护法律秩序和受害者权益。

法律依据：

• 《中华人民共和国刑法》第六十四条规定：“犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。”
• 《最高人民法院关于刑事裁判涉财产部分执行的若干规定》也明确了追缴或责令退赔的具体操作和要求。

综上所述，在非法放贷刑事案件中，已经退赔的财物通常不会再被扣押或没收为违法所得，但这一处理原则并非绝对，而是会根据具体情况和法律规定进行灵活调整。若您或您身边的人面临类似问题，建议及时咨询专业律师以获取更准确的法律意见和帮助。