针对您提出的“营运客车超员扣分后怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，营运客车超员是一种违法行为，将受到相应的法律处罚。具体处罚措施包括：

1. 罚款：

   • 公路客运车辆载客超过额定乘员的，将处二百元以上五百元以下罚款。
   • 若超过额定乘员百分之二十或者违反规定载货，则罚款金额将提升至五百元以上二千元以下。

2. 扣分：

   • 营运车辆如有超载行为，驾驶员的驾照将被扣除相应的分数。具体来说，每超一人，驾驶员将被扣除驾照总分的六分之一（这一规定可能因地区或具体政策有所差异，请以当地交通管理部门的规定为准）。

3. 扣留机动车：

   • 对于存在超员行为的营运客车，公安机关交通管理部门将扣留机动车，直至违法状态消除。

4. 对运输单位的处罚：

   • 如果运输单位的车辆存在超员等违法行为，并且经处罚后仍未改正，那么对直接负责的主管人员将处二千元以上五千元以下罚款。

在扣分后，驾驶员需要按照以下步骤进行处理：

1. 接受处罚：

   • 驾驶员应前往指定的交通管理部门或交警大队接受处罚，缴纳罚款，并领取相关的处罚决定书。

2. 处理扣分：

   • 扣分将记录在驾驶员的驾照上，影响驾驶员的驾照分数和驾驶信用。驾驶员需要关注自己的驾照分数情况，确保不会因扣分过多而导致驾照被暂扣或吊销。

3. 加强法规学习：

   • 驾驶员应加强对《中华人民共和国道路交通安全法》等相关法律法规的学习，提高交通安全意识，确保今后不再发生类似的违法行为。

4. 整改与预防：

   • 运输单位应加强对驾驶员的管理和教育，确保车辆不超员、不超载。同时，应建立健全的安全管理制度，预防类似违法行为的再次发生。

综上所述，营运客车超员扣分后，驾驶员需要接受处罚、处理扣分，并加强法规学习和整改预防措施。希望这些信息能对您有所帮助。