框架合同招标代理服务费的计算方式并不是一个固定的标准，而是根据多种因素综合确定的。以下是对框架合同招标代理服务费计算方式的详细解答：
一、收费方式与标准的确定
协商确定：
- 招标代理服务费的收费方式及标准，通常由委托人与代理机构在签订委托代理协议时协商确定，并明确在协议中。
- 根据《政府采购代理机构管理暂行办法》规定，代理机构与采购人应签订委托代理协议，明确代理费用收取方式及标准等具体事项。
市场调节：
- 自国家发改委发布相关决定废止《招标代理服务收费管理暂行办法》后，招标代理服务收费已经取消政府指导价，改为市场调节价。
- 这意味着，代理服务费的收费标准更多地依赖于市场供需关系和双方的协商结果。
二、框架协议采购的代理费用收取方式
框架协议采购的代理费用收取方式通常分为一次收费和二次收费两种模式：
一次收费模式：
- 主要适用于第二阶段无竞争的框架协议采购。
- 在这种情况下，采购代理机构仅在第一阶段提供代理服务，因此仅就第一阶段的代理服务进行收费。
二次收费模式：
- 主要适用于第二阶段有竞争的框架协议采购。
- 如果第二阶段采用二次竞价方式确定成交供应商，代理机构可以根据自己提供的服务在框架协议采购的两个阶段分别收费。
三、代理服务费取费基数及计算方式
取费基数：
- 框架协议采购代理服务费的取费基数可能因情况而异。
- 如果第一阶段无法确定入围供应商供货份额，通常以框架协议采购的总预算为取费基数。
- 如果第一阶段能确定入围供应商的供货份额及单价，则以预估供货金额为取费基数分别计算。
计算方式：
- 以总预算为取费基数时，通常需要将计算结果除以最终入围供应商的数量，即所有入围供应商平摊第一阶段的采购代理服务费。
- 以预估供货金额为取费基数时，则按照征集文件明示的收费标准进行计算，通常是根据相关规定上下浮动一定比例进行计算。
四、其他注意事项
- 无论采用何种收费模式，均应当在征集文件中予以明示，并随入围结果公告一并公开。
- 代理机构在收费时应遵循公平、公正、合理原则，不得恶意抬高或压低收费标准。
- 招标人在选择代理机构时，应充分考虑其服务质量、专业能力和收费水平等因素。
综上所述，框架合同招标代理服务费的计算方式是一个复杂的过程，需要综合考虑多种因素。在实际操作中，建议委托人与代理机构充分沟通、协商确定，并明确在委托代理协议中。