结论前置：如果父亲在遗嘱中明确将房产留给母亲，且该遗嘱合法有效，那么法院通常会尊重遗嘱的内容，将房产判给母亲，而不是女儿。

详细分析：

1. 遗嘱的法律效力：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，遗嘱是遗嘱人生前在法律允许的范围内，按照法律规定的方式对其遗产或其他事务所作的个人处理，并于遗嘱人死亡时发生效力的法律行为。
   • 如果父亲在生前立下了合法有效的遗嘱，且该遗嘱中明确将房产留给母亲，那么这份遗嘱就具有法律效力。

2. 法院的判决依据：

   • 在处理遗产继承纠纷时，法院会首先审查遗嘱的合法性、真实性和有效性。
   • 如果遗嘱被认定为合法有效，且内容明确无歧义，法院通常会按照遗嘱的内容来分配遗产。

3. 女儿的权利：

   • 在遗嘱继承的情况下，如果遗嘱中没有提到女儿作为继承人，那么女儿通常无法直接继承该房产。
   • 当然，如果女儿认为遗嘱存在无效或可撤销的情形，她可以通过法律途径提出异议，并要求法院对遗嘱进行审查。

4. 特殊情况：

   • 如果母亲在父亲去世后也去世了，且没有留下新的遗嘱或遗赠扶养协议，那么房产将按照法定继承的规则进行分配，此时女儿可能作为法定继承人之一参与房产的分配。

综上所述，如果父亲在遗嘱中明确将房产留给母亲，且该遗嘱合法有效，那么法院通常会尊重遗嘱的内容，将房产判给母亲。女儿如果对此有异议，需要通过法律途径提出并证明遗嘱存在无效或可撤销的情形。如果你还有其他关于婚姻家庭或离婚领域的问题，可以直接向我咨询。