针对你提出的问题，即“判决双方互负债务，无先后顺序，但一方要履行对方不配合，对方以申请方未履行完为由拒绝履行”，以下是我的详细解答：

结论前置：在双方互负债务且无先后顺序的情况下，一方申请执行并不以另一方完全履行为前提，且一方申请执行将导致另一方的申请执行时效中断。若双方均未履行，则双方均可依据生效判决向法院申请强制执行，同时法院在执行过程中会考虑双方的债务情况进行抵扣。

详细分析：

1. 同时履行抗辩权的应用：

   • 当双方互负债务且无先后履行顺序时，适用同时履行抗辩权。即双方应同时履行，一方在对方未履行或履行不符约定时，有权拒绝其相应的履行请求。
   • 但在此情况下，若一方已经向法院申请执行，表明其愿意履行判决中的义务，并希望通过法律程序解决争议。因此，另一方的同时履行抗辩权在此阶段并不构成阻碍执行的有效理由。

2. 申请执行时效的中断：

   • 根据相关法律规定和司法实践，生效判决判令双方当事人互负债务且没有先后履行顺序时，一方申请执行也将导致另一方的申请执行时效中断。
   • 这意味着，即使另一方在申请执行时认为申请方未完全履行，但其申请执行的权利并未因此丧失，而是可以在申请执行时效内随时向法院提出。

3. 法院的执行程序：

   • 在执行过程中，法院会综合考虑双方的债务情况，进行抵扣或采取其他执行措施以确保判决的履行。
   • 若双方对执行过程或结果有异议，均可通过法律程序向法院提出执行异议或复议。

综上所述：

• 在双方互负债务且无先后顺序的情况下，一方申请执行并不以另一方完全履行为前提。
• 一方申请执行将导致另一方的申请执行时效中断，另一方仍可在时效内申请执行。
• 法院在执行过程中会综合考虑双方的债务情况进行抵扣或采取其他执行措施。

因此，若你面临此类情况，建议积极与法院沟通，了解执行进展，并根据实际情况采取相应的法律措施以维护自身权益。若你有进一步的法律问题或需要具体的法律建议，请直接向我咨询。