医药公司当法人，一般不会直接查询配偶的犯罪记录。下面我为您详细解释这一点：

在设立医药公司或担任公司法人时，主要的审查和关注点通常集中在申请人或法人的个人资质、信用状况、经营能力等方面。这些审查通常是为了确保公司的合法经营、保护投资者和消费者的权益。而配偶的犯罪记录，一般并不属于这些直接审查的范畴。

1. 公司设立与法人资格：根据相关法律法规，设立公司需要满足一定的条件，如注册资本、公司章程、股东结构等。在这些条件中，并未明确提及需要审查法人配偶的犯罪记录。

2. 特定行业的特殊要求：虽然某些特定行业（如金融、教育等）可能对从业人员的背景有更严格的审查要求，但医药行业通常并不直接涉及对法人配偶犯罪记录的审查。当然，如果公司需要申请某些特定的行政许可或资质认证，可能会涉及对相关人员（包括法人及其配偶）的某些背景调查，但这并非普遍情况。

3. 隐私保护与法律原则：在法律上，个人的犯罪记录通常属于隐私范畴，受到法律的保护。除非有明确的法律依据或特定程序，否则不得随意查询或公开他人的犯罪记录。因此，在没有法律依据的情况下，公司或相关部门不能随意查询法人配偶的犯罪记录。

综上所述，医药公司当法人时，一般不会直接查询配偶的犯罪记录。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。