业主共有的物业用房不属于商品房，其存在是合法的。具体分析如下：

一. 业主共有的物业用房不属于商品房

• 根据上海市房屋管理局的通知，“业主共有房地产”包括物业管理用房等，这些房地产是依法归业主共有的，并非用于销售的商品房。
• 商品房是指房地产开发企业用于销售的房地产，与业主共有的房地产有明确的区分。

二. 业主共有的物业用房的存在是合法的

• 根据通知要求，房地产开发企业在申请新建商品房所有权首次登记前，需要列明业主共有的房地产，并提供相关证明材料。
• 区房管局会对房地产开发企业所提交的材料进行审核，对规划批准文件（图纸）和楼盘表进行核对，无疑义后会对业主共有房地产的内容、部位等进行认定。
• 这一流程确保了业主共有的物业用房在规划和权属上的合法性。

综上所述，业主共有的物业用房不属于商品房范畴，其作为业主共有的房地产，在规划和权属上均经过相关部门的审核和认定，因此其存在是合法的。如有进一步需要，您可以继续咨询我。