在单位因自身疾病晕倒受到二次伤害是否算工伤，需要根据具体情况来判断。以下是对此问题的详细分析：

1. 可认定为工伤的情形：

   • 如果员工在工作时间和工作岗位上因自身疾病晕倒，并因此受到二次伤害，且这种伤害达到了工伤认定的程度标准（如骨折、严重摔伤等），同时能证明晕倒与工作存在直接因果关系（如因工作强度过大、工作环境恶劣导致晕倒），那么这种情况有可能被认定为工伤。
   • 另一种情况是，如果员工在晕倒后48小时内因抢救无效死亡，那么根据《工伤保险条例》的规定，这种情况可以视同工伤。

2. 不能认定为工伤的情形：

   • 如果员工晕倒是由于自身疾病突发导致的，且并未造成其他严重后果（如死亡、残疾等），或者晕倒与工作没有直接关系，那么这种情况一般不被认定为工伤。
   • 此外，如果晕倒后受到的二次伤害较轻，未达到工伤认定的程度标准，那么这种情况也不宜认定为工伤。

3. 工伤认定的流程：

   • 员工或用人单位在认为晕倒及二次伤害符合工伤认定条件时，应及时向当地社会保险行政部门提出工伤认定申请，并提交相关证据材料。
   • 社会保险行政部门将依法进行调查核实，并作出是否认定为工伤的决定。

4. 法律建议：

   • 在处理此类问题时，建议员工和用人单位都保留好相关证据材料，如医疗记录、事故报告、监控视频等，以便在需要时进行举证。
   • 如果对工伤认定结果有异议，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼来维护自己的合法权益。

综上所述，在单位因自身疾病晕倒受到二次伤害是否算工伤是一个复杂的问题，需要根据具体情况和法律法规来判断。如果你或你身边的人遇到了类似的情况，建议及时向我咨询，以便获取更准确的法律意见和指导。