赌博罪违法所得不会扣除赌本。

在赌博罪案件中，违法所得是指通过实施赌博活动这一违法犯罪行为所创造的全盘收益，它涵盖了参赌者投入的赌本以及吃率抽水和其他类似的附加收益。在司法实践中，相关机构会对所有的收入进行详尽的核算，而并不涉及成本扣除问题。也就是说，赌博罪的违法所得是包括赌本在内的全部收益，都会被认定为非法所得并予以没收。

因此，对于赌博罪来说，违法所得并不会扣除赌本。赌博行为不仅违法，而且会对个人、家庭和社会造成严重的负面影响。建议远离赌博，遵守法律法规，珍惜自己的财产和家庭。