原告主张欠款，法院认定为借款是否合法，取决于具体的证据和法律规定。以下是对这一问题的详细分析：

1. 法律关系的认定：

   • 在民间借贷纠纷中，法院会根据当事人提供的证据来认定双方之间的法律关系。
   • 如果原告主张被告欠款，而法院在审理过程中发现双方实际上存在的是借款关系，并且这一关系符合借款合同的法律特征（如存在借贷合意、款项已实际交付等），那么法院将依法认定为借款关系。

2. 证据的审查：

   • 法院在认定法律关系时，会严格审查当事人提供的证据。
   • 这些证据可能包括借条、转账记录、聊天记录、证人证言等，用于证明双方之间存在借贷合意以及款项的交付情况。

3. 法律规定的适用：

   • 法院在认定借款关系时，会依据《中华人民共和国民法典》等相关法律法规的规定。
   • 如果双方之间的借款关系符合法律规定的要件，那么法院将依法予以保护。

4. 合法性的判断：

   • 法院将根据证据和法律规定，对双方之间的借款关系进行合法性判断。
   • 如果借款关系合法有效，法院将支持原告的诉讼请求；如果借款关系存在违法情形（如高利贷、诈骗等），法院将依法予以驳回或作出其他相应处理。

综上所述，原告主张欠款而法院认定为借款是否合法，取决于具体的证据和法律规定。如果双方之间的借款关系符合法律规定的要件，并且证据充分，那么法院的认定将是合法的。因此，在处理此类纠纷时，当事人应提供充分的证据来证明自己的主张，并依法维护自己的合法权益。