关于员工入职集团公司主体，但与子公司签署股份协议后能否要回股金的问题，这主要取决于具体的协议内容以及相关的法律规定。以下是我根据不同情况给出的分析：

1. 协议有明确约定：

   • 如果员工与子公司签署的股份协议中明确规定了股金退还的条件和方式，那么员工在符合这些条件时，有权要求子公司按照协议约定退还股金。

2. 协议无明确约定，但存在法定情形：

   • 若协议中未明确约定股金退还，但根据《公司法》等相关法律规定，存在某些法定情形（如公司连续五年不向股东分配利润，而公司该五年连续盈利，并且符合本法规定的分配利润条件的；公司合并、分立、转让主要财产的等），员工可以要求公司回购其持有的股份，从而间接实现股金的退还。

3. 协议无明确约定，且无法定情形：

   • 如果协议中既未约定股金退还条件，也不存在上述法定情形，那么员工通常不能随意要求子公司退还股金。此时，员工可以考虑通过向其他股东或第三人转让股权的方式来退出投资，并获取相应的对价。

综上所述，员工能否要回股金，关键在于股份协议的具体内容以及是否存在相关的法律规定。因此，建议员工在签署股份协议前，务必仔细阅读协议条款，了解股金退还的相关规定，以避免后续产生不必要的纠纷。如果协议内容复杂或存在疑问，可以寻求专业律师的帮助进行解读和咨询。