领导分配有争议的公款，如果未经合法程序擅自处理，很可能构成违法。下面我将对此进行详细分析：

一. 公款分配需遵循法定程序

1. 公款性质：公款属于国家或集体的财产，其分配和使用必须严格遵守相关法律法规和财务制度。
2. 法定程序：对于公款的分配，通常需要经过严格的审批和决策程序，确保资金的合理、合法使用。

二. 擅自分配公款可能构成违法

1. 违反财务规定：如果领导未经合法程序，擅自将有争议的公款进行分配，这首先就违反了财务管理的相关规定。
2. 可能构成贪污、挪用公款等犯罪：根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，贪污罪是指国家工作人员利用职务上的便利，侵吞、窃取、骗取或者以其他手段非法占有公共财物的行为。挪用公款罪则是指国家工作人员利用职务上的便利，挪用公款归个人使用，进行非法活动的，或者挪用公款数额较大、进行营利活动的，或者挪用公款数额较大、超过三个月未还的行为。领导擅自分配有争议的公款，如果符合这些犯罪的构成要件，就可能面临刑事责任。

三. 争议解决应依法进行

1. 争议处理：对于公款的争议，应当通过合法的途径和程序来解决，如协商、调解、仲裁或诉讼等。
2. 避免擅自处理：在争议解决之前，领导应当保持公正、中立的态度，避免擅自处理公款，以免引发更大的法律风险和纠纷。

综上所述，领导分配有争议的公款，如果未经合法程序擅自处理，很可能构成违法。我建议领导在处理公款争议时，应严格遵守法律法规和财务制度，通过合法的途径和程序来解决争议，确保资金的合理、合法使用。如有进一步需要，您可以继续咨询我。