员工删除商品链接，如果构成破坏计算机信息系统罪，则是违法的。具体是否违法，需要根据实际情况来判断。下面我将从不同角度为你详细分析：

1. 一般情况下的分析：

   • 员工在未经授权的情况下删除商品链接，首先可能构成对公司财产的侵害，因为商品链接往往承载着公司的商业利益和客户积累。
   • 如果这种行为导致了公司经济利益的损失，且损失达到一定数额，员工可能需要承担民事赔偿责任。

2. 构成破坏计算机信息系统罪的情况：

   • 根据刑法规定，违反国家规定，对计算机信息系统功能进行删除、修改、增加、干扰，造成计算机信息系统不能正常运行，后果严重的，可能构成破坏计算机信息系统罪。
   • 在电商公司中，商品链接是计算机信息系统的一部分，如果员工故意删除这些链接，导致系统功能受损，且后果严重（如销售额大幅下降、客户流失等），则可能构成此罪。
   • 实际上，已有案例表明，员工因删除公司商品链接而被法院以破坏计算机信息系统罪判处有期徒刑。

3. 法律建议：

   • 对于公司而言，应加强对员工的管理和培训，确保员工了解并遵守相关法律法规和公司规章制度。
   • 一旦发现员工有删除商品链接等违法行为，公司应及时固定证据，并报警处理。
   • 对于员工而言，如果对公司存在不满或纠纷，应通过合法途径解决，而不是采取删除商品链接等报复行为。

综上所述，员工删除商品链接是否违法，需要根据具体情况来判断。如果这种行为构成了对公司财产的侵害或破坏了计算机信息系统的正常运行，且后果严重，那么员工是需要承担法律责任的。因此，建议公司和员工都应遵守相关法律法规，维护良好的商业环境和工作关系。