工伤认定被法院撤销后，单位支付的医疗费一般需要退回。以下是对此结论的详细解释：

1. 工伤认定的重要性：

   • 工伤认定是职工享受工伤保险待遇的前提。一旦工伤认定被撤销，就意味着职工所受伤害不再被视为工伤，因此也就不再享受工伤保险的相关待遇。

2. 医疗费支付的原则：

   • 根据《工伤保险条例》，职工因工作遭受事故伤害或患职业病进行治疗时，符合工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准的费用，会从工伤保险基金支付。
   • 若公司先行垫付了这些费用，之后可从工伤保险基金进行结算。但在工伤认定被撤销的情况下，公司垫付的费用就失去了从工伤保险基金结算的依据。

3. 医疗费退回的必要性：

   • 既然工伤认定已被撤销，那么单位支付的医疗费（无论是直接支付还是通过工伤保险基金间接支付）就失去了合法的支付依据。
   • 因此，从法律上讲，单位有权要求职工退回已支付的医疗费。

4. 特殊情况的处理：

   • 如果单位与职工之间有特别的约定，或者单位垫付的费用超出了法定标准，那么可能需要根据实际情况协商退还部分费用。
   • 但这种特殊情况并不影响一般原则的适用，即工伤认定被撤销后，单位支付的医疗费通常需要退回。

综上所述，工伤认定被法院撤销后，单位支付的医疗费一般需要退回。如果对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。