针对“施工单位严重亏损，支部书记怎么被处理”的问题，首先需要明确的是，处理方式和具体情节、公司规定、法律法规等多个因素有关，无法一概而论。以下是从几个不同角度进行的分析：

1. 公司内部规定与责任追究：

   • 支部书记作为施工单位的管理人员，其职责包括监督和管理公司的运营。若亏损是由于支部书记的管理不善、决策失误或违反公司规定导致的，公司可能会依据内部规章制度对其进行处理，如降职、调岗、罚款甚至解除劳动合同等。
   • 处理的具体方式还需根据公司章程、劳动合同以及员工手册等文件来确定，这些文件通常会明确员工的行为规范和违规处理办法。

2. 法律法规与责任承担：

   • 如果施工单位的亏损涉及到违法犯罪行为，如贪污、挪用公款、虚假报告等，支部书记作为责任人之一，可能会受到法律的制裁。这包括但不限于刑事责任、行政处罚以及民事赔偿等。
   • 在此情况下，处理方式将由司法机关根据相关法律法规进行决定，可能涉及拘留、有期徒刑、罚款等刑罚。

3. 行业监管与纪律处分：

   • 施工单位通常受到行业监管机构的监督和管理。若亏损是由于违反行业规定或标准导致的，监管机构可能会对支部书记进行纪律处分，如警告、罚款、吊销执业资格等。
   • 这种处理旨在维护行业秩序和公平竞争，保护消费者权益和社会公共利益。

综上所述，施工单位严重亏损时，支部书记的处理方式取决于具体情节、公司规定、法律法规以及行业监管要求。在面临此类问题时，建议公司及时咨询专业律师，以确保处理方式的合法性和合规性。同时，支部书记也应积极配合调查，主动承担责任，以期得到公正、合理的处理结果。