在工程款纠纷中，起诉时是可以主张本金及利息的。以下是对这一结论的详细解释：

1. 法律依据：

   • 根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》的相关规定，当事人对欠付工程价款利息计付标准有约定的，应按照约定处理。这意味着，如果施工合同中明确规定了逾期支付工程款的利息计算方式，承包人可以直接依据这些条款要求发包人支付利息。
   • 即便合同中没有明确约定利息，但发包人存在拖欠工程款的行为，且该行为给承包人造成了实际损失，承包人在起诉时仍然可以主张相应的利息损失赔偿。此时，利息的计算将依据同期同类贷款利率或者同期贷款市场报价利率进行。

2. 利息的起算时间：

   • 如果建设工程已实际交付，利息从交付之日算起。
   • 如果建设工程没有交付，但从承包人提交竣工结算文件之日起算。
   • 如果建设工程既未交付，工程价款也未结算，利息从承包人起诉之日起算。

3. 实例说明：

   • 假设甲建筑公司为乙公司承建办公楼，双方合同约定工程竣工结算后30日内支付全部工程款。若工程于某年5月1日竣工并交付使用，但乙公司拖延至8月1日仍未支付工程款，则甲公司可以从约定的支付期限届满之次日起（如合同约定6月1日前支付，则从6月2日起算）按照同期贷款市场报价利率主张利息。

综上所述，在工程款纠纷中，承包人不仅可以主张本金，还可以依法主张利息以保障自身的合法权益。如果你在实际操作中遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供进一步的法律建议和支持。