委托加工中，委托商不能使用被委托商的绿色食品标志。具体分析如下：

一. 委托加工中的条码使用规定

1. 规定内容：根据《国家质量监督检验检疫总局关于<商品条码管理办法>实施过程中有关问题意见的函》(质检办法函〔2008〕67号)第四点第一项规定，委托他人加工产品的，应当使用委托方注册的厂商识别代码及相应的商品条码。
2. 实际案例：在提供的案例中，重庆XX汇电子商务有限公司作为委托方，在商品外包装上使用了被委托方重庆野XX生物科技有限公司的商品代码，这一行为被认定为违反了《商品条码管理办法》的相关规定，并因此受到了行政处罚。

二. 绿色食品标志的使用规定

1. 绿色食品定义：绿色食品是指产自优良生态环境、按照绿色食品标准生产、实行全程质量控制并获得绿色食品标志使用权的安全、优质食用农产品及相关产品。
2. 标志使用权：绿色食品标志的使用权是依法授予特定生产者的，未经授权，任何单位和个人不得擅自使用。
3. 委托加工中的使用：在委托加工关系中，虽然被委托方可能具备生产绿色食品的能力和资质，但绿色食品标志的使用权属于委托方或被明确授权的一方。委托方不能简单地因为委托了加工就使用被委托方的绿色食品标志。

三. 推理总结

1. 条码使用：委托加工中应使用委托方的条码，这是明确的法律规定。
2. 绿色食品标志：同样地，绿色食品标志的使用也应遵循相应的法律规定和授权原则。委托商不能因委托加工关系而自动获得使用被委托商绿色食品标志的权利。
3. 结论：因此，在委托加工中，委托商不能使用被委托商的绿色食品标志，除非获得了明确的授权。

我建议您在委托加工前，明确与被委托方就条码和绿色食品标志的使用进行协商，并确保获得必要的授权或许可。如有进一步需要，您可以继续咨询我。