牌照被偷后若发生违章，应先报警并补办牌照，然后向交警部门申诉撤销违章。具体分析如下：

一. 立即报警并补办牌照

• 车牌被盗属于违法行为，及时报警有助于警方介入调查，并可为后续处理提供重要凭证。应立即拨打当地报警电话（如110），详细告知警方车牌被盗的时间、地点、车辆信息。
• 报警后，前往车管所补办牌照。需准备机动车所有人的身份证明、机动车行驶证、报案证明或出警记录等材料。填写《机动车牌证申请表》，缴纳补办车牌的费用，并领取新牌照。

二. 向交警部门申诉撤销违章

• 携带身份证、非机动车行驶证等材料前往被拍照所在地的交通队进行信息核实，确认是否因车牌被盗用而产生的违章。
• 向工作人员说明车牌被盗的情况，并提交报案证明、补办牌照的相关材料等作为证据，提出申诉请求以撤销违章记录。
• 积极配合交警部门和公安机关的调查，定期沟通了解处理进度，确保问题得到及时解决。

三. 加强防范与告知

• 为防止车牌再次被盗，应加强车辆的安保措施，如安装防盗装置，选择安全停车地点。
• 若车辆常出入特定场所，应及时向这些场所的管理部门通报车牌被盗情况，避免不必要的误会。

我建议您按照上述步骤处理牌照被偷后违章的问题，确保自身权益得到维护。同时，也请您加强防范意识，避免类似情况再次发生。如有进一步需要，您可以继续咨询我。