公司因串标被部队处罚，应首先接受处罚并积极整改，同时寻求法律途径来维护自身合法权益。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 接受处罚与整改

1. 接受处罚：公司应正视被部队处罚的事实，按照处罚决定的要求，及时缴纳罚款、退还非法所得等，以表明公司的认错态度和整改决心。
2. 积极整改：针对串标行为，公司应进行内部自查自纠，找出问题根源，完善内部管理制度，加强员工法律意识和职业道德教育，确保今后不再发生类似行为。

二. 寻求法律途径维护权益

1. 申请行政复议或行政诉讼：如果公司认为部队的处罚决定存在错误或不当之处，可以在法定期限内向上一级部队机关申请行政复议，或者向人民法院提起行政诉讼，要求撤销或变更处罚决定。
2. 寻求法律援助：在申请行政复议或行政诉讼过程中，公司可以聘请专业律师提供法律援助，以确保自身合法权益得到有效维护。律师可以帮助公司分析案情、准备证据材料、撰写法律文书等。

三. 加强合规管理

1. 完善招投标制度：公司应建立健全招投标管理制度，明确招投标流程、审批权限和责任分工，确保招投标活动的公开、公平、公正。
2. 加强员工培训：定期对员工进行招投标法律法规和职业道德培训，提高员工的法律意识和职业素养，防止类似行为再次发生。

我的观点：公司因串标被部队处罚是一件严重的事情，不仅会影响公司的声誉和信誉，还可能对公司的经营和发展造成不利影响。因此，公司应正视问题，积极整改，并寻求法律途径来维护自身合法权益。同时，加强合规管理也是预防类似问题再次发生的关键。如有进一步需要，您可以继续咨询我。