针对您提出的“市级文物保护单位未经批准擅自修缮该怎么处罚”的问题，以下是我根据相关法律法规和具体案例为您提供的详细解答：
一、法律法规依据
根据《中华人民共和国文物保护法》的相关规定，对文物保护单位进行修缮，必须根据文物保护单位的级别报相应的文物行政部门批准。具体来说：
- 第二十一条第二款：对文物保护单位进行修缮，应当根据文物保护单位的级别报相应的文物行政部门批准；对未核定为文物保护单位的不可移动文物进行修缮，应当报登记的县级人民政府文物行政部门批准。
- 第二十一条第四款：对不可移动文物进行修缮、保养、迁移，必须遵守不改变文物原状的原则。
- 第六十六条：有下列行为之一，尚不构成犯罪的，由县级以上人民政府文物主管部门责令改正，造成严重后果的，处五万元以上五十万元以下的罚款；情节严重的，由原发证机关吊销资质证书。其中第四项即为“擅自修缮不可移动文物，明显改变文物原状的”。
二、具体处罚案例
以陆丰市文化广电旅游体育局查处的一起擅自修缮不可移动文物案件为例：
- 基本案情：2024年10月，陆丰市文化广电旅游体育局执法人员在文物巡查中发现，辖区内一处不可移动文物正在进行修缮作业，但实施修缮的单位并未依法履行审批手续。经核查，该修缮行为已对文物的历史风貌和本体结构造成破坏。
- 处罚决定：依据《中华人民共和国文物保护法》的相关规定，陆丰市文化广电旅游体育局对擅自修缮文物的单位作出了罚款6万元的行政处罚决定。
三、处罚措施与后果
- 责令改正：县级以上人民政府文物主管部门会首先责令擅自修缮文物的单位或个人立即停止违法行为，并采取措施恢复文物原状。
- 罚款：如果擅自修缮行为造成严重后果，将处以五万元以上五十万元以下的罚款。具体罚款数额会根据违法行为的严重程度、对文物造成的破坏程度以及修复成本等因素综合考虑。
- 吊销资质证书：对于情节严重的违法行为，原发证机关还可能吊销相关单位的文物修缮资质证书，禁止其再次从事文物修缮活动。
四、建议与提醒
- 增强文物保护意识：各单位和个人应增强文物保护的法律意识，了解并遵守相关法律法规，依法依规开展文物修缮工作。
- 规范文物修缮流程：文物修缮工作必须遵循严格的规范和标准，确保修缮工作科学、规范、安全。在修缮前，应依法办理审批手续，并委托具备相应资质的单位进行修缮。
- 加强社会监督：全社会应共同参与文物保护工作，发现涉及文物的违法违规行为时，应及时向文物行政部门举报，共同守护我们的文化遗产。
综上所述，市级文物保护单位未经批准擅自修缮是违法行为，将受到法律的制裁。因此，建议各单位和个人在涉及文物修缮等活动时，务必依法依规进行，共同维护我们的文化遗产。